比较显微镜属于特种显微镜，它不仅有普通显微镜的作用，而且能用一组目镜同时观察左右两个系统物方物体的像。并通过对接、切割、重叠、旋转等手段，对两个或两个以上的物体进行宏观或微观上的比较，以检查它们在形式、组织、结构、色彩或材料上存在的微小差异，以达到鉴别、比较的目的。
适用范围
比较显微镜用于公、检、法技术部门做刑侦物证、文物鉴定和教学的理想仪器，适用于银行、税务、印刷、钱币、考古、生物工程、电子学及需要对物体进行比较鉴定的各个部门，随着经济的发展比较显微镜正在逐步普及使用。
类别
从使用对象上分，根据不同用户的需要有不同的品种，其中有适合司法鉴定、银行、电子、商检、质检、农科等部门的普通比较显微镜;有适合医药、生物、化工等部门使用的生物比较显微镜;还有适合冶金、机械、材料学等部门需要的金相比较显微镜。
从仪器的精密程度和功能上分，有大型、中型和普及型三类，大型高等比较显微镜多为型，仪器精度高、附件多，能进行荧光、偏光、相衬、干涉相衬观察、电动操作等;普及型比较显微镜结构简单、操作灵活、便于携带，实用性强;中型比较显微镜性能介于大型和普及型之间。
从技术指标上分，国产与进口比较显微镜的差距正在缩小，就光学系统设计水平而言，国产比较显微镜毫不逊色。国产仪器的主要缺陷表现在款式设计、表面处理工艺、仪器传动精度等方面。